| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM180355 | = 990470 | 50 (0.700) | 15 (0.210) | 15/286 | 2.6 | 23.3% | intergenic (+1/‑648) | bglF1/tlpB1 | PTS system, beta‑glucoside‑specific IIABC component, bglF1/Transposase‑like protein B |
| ? | AM180355 | 992355 = | 49 (0.690) | coding (2/81 nt) | bglF1 | PTS system, beta‑glucoside‑specific IIABC component, bglF1 | |||||
TTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATCAACAATTAAATACATCT > AM180355/992207‑992502 | gagttaaatggtaaatactttacaaaacatgttaatcaaggagatttagtgaaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgatttt > 1:277927‑M2/149‑150 (MQ=255) gtaaatactttacaaaacatgttaatcaaggagatttagtgaaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCa > 1:100179‑M2/139‑145 (MQ=255) aaCAATTCAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGTCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCa > 2:1024943/1‑144 (MQ=21) aaCAATTCAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCa < 2:602792/144‑1 (MQ=34) aTTCAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCt > 2:21541/1‑150 (MQ=255) cAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGt > 1:64096/1‑150 (MQ=255) aaataaCTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATc < 2:1029737/149‑1 (MQ=255) aaataaCTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATc < 1:1111056/149‑1 (MQ=255) aCTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTaa < 1:500073/141‑1 (MQ=255) caaggagatttagtgaaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGt > 2:623614‑M2/113‑141 (MQ=255) ggagatttagtgaaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAAcc < 2:869111‑M2/41‑1 (MQ=255) gAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAAcc > 1:581591/1‑150 (MQ=255) gTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATg > 2:523228/1‑149 (MQ=255) ggAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAAt < 2:585451/145‑1 (MQ=255) ggAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAAt > 2:154547/1‑145 (MQ=255) ggAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGGTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAAt < 2:23825/145‑1 (MQ=255) aaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCt < 2:1028438‑M2/26‑1 (MQ=255) aaaaaaggtgataaacttatatcgtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCt > 1:1026606‑M2/98‑123 (MQ=255) gATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCAt < 2:381056/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTc > 2:907127/1‑143 (MQ=255) 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1:82976/1‑150 (MQ=255) ttAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTa > 2:566063/1‑149 (MQ=255) gtttgatatagataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTa > 2:753363‑M2/75‑149 (MQ=255) tAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAAt > 2:762794/1‑150 (MQ=255) gTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTc < 2:350769/129‑1 (MQ=255) gTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTc > 1:350109/1‑129 (MQ=255) gTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGt > 1:717056/1‑135 (MQ=255) gTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGt > 2:179269/1‑135 (MQ=255) gACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGtt > 1:900037/1‑150 (MQ=255) agataaaataaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTa > 2:511534‑M2/66‑140 (MQ=255) atTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAAttt < 1:232983/150‑1 (MQ=255) atTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAAttt > 2:578201/1‑150 (MQ=255) atTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAAttt < 2:1055505/150‑1 (MQ=255) ttttAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAAt > 2:77396/1‑147 (MQ=255) gTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACt > 1:981650/1‑148 (MQ=255) aaaaaaggctggttatgatgtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTa < 2:100359‑M2/84‑1 (MQ=255) aTGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTagag < 1:154275/150‑1 (MQ=255) aTGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTagag < 1:433083/150‑1 (MQ=255) gCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGAt < 1:658871/150‑1 (MQ=255) gCAAAATGCTATGAAGCAGGAGCCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAgaga < 2:414835/149‑1 (MQ=255) gtaactacgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGAttt > 1:1001823‑M2/38‑149 (MQ=255) acgccagttatagtaaacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAg < 1:751935‑M2/117‑1 (MQ=255) 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aacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaac < 1:705419‑M2/134‑1 (MQ=255) aacaatacatttgattTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTA‑TAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca < 2:35713‑M2/134‑1 (MQ=255) cATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaac > 1:353869/1‑149 (MQ=255) cATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaac < 1:975974/149‑1 (MQ=255) gggAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATCAACAAt < 2:846381/149‑1 (MQ=255) gggAGGTTCAGTTTGAGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAAATTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAATAAATCATCAAt < 2:64201/149‑1 (MQ=255) ggAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca > 2:1054300/1‑146 (MQ=255) ggTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca > 2:718875/1‑143 (MQ=255) ggTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca > 2:907969/1‑143 (MQ=255) tCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca < 1:1085363/140‑1 (MQ=255) aGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATCAACAATTAAATACATc > 1:94329/1‑150 (MQ=255) gTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATCAACAATTAAATACATCt > 1:92561/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATcaaca < 1:877070/135‑1 (MQ=255) | TTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAACTTATGTAAGAACCGTAGGAACTACGGGGATAGCCTGTGGAGAATTAGTAAGACATATTTTAGTATGCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAAATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAAGTTAATTTGACTAGAGATAAGTAAATTGATTTAAAAGGAAATAAGTAAATCAACAATTAAATACATCT > AM180355/992207‑992502 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |